Definidos classificados à segunda fase

Rio Branco-AC, Paysandu, Icasa, Asa, América-MG, Guaratinguetá, Caxias e Brasil-RS foram as equipes que se classificaram para a segunda fase da Série C 2009.

Destes apenas Rio Branco e Brasil não estavam entre os favoritos da enquete do blog.

As quartas-de-final ficaram assim definidas:
Rio Branco x ASA
Icasa x Paysandu
América-MG x Caxias
Brasil-RS x Guaratinguetá

Os resultados da última rodada também confirmaram as quatro equipes rebaixadas para a Série D 2010: Sampaio Correa-MA, Confiança, Mixto e Marcílio Dias.